Az EDI (Electronic data interchange) egy olyan zárt rendszer, amelyen keresztül a partnerek között teljes mértékben elektronikus módon történik az adatok küldése és fogadása. Az adatok nem csak számlákra, de rendelésekre, szállítólevelekre és egyéb - a két partner között létrejött - tranzakcióra is vonatkozhatnak. EDI rendszert általában nagy cégek használnak, akik már jóval az elektronikus számla tömeges elterjedése előtt szerették volna a papíros bizonylatok utaztatását elkerülni, ezáltal is hatékonyabbá tenni a működésüket. Az EDI egy interfész valójában, bármelyik számlázó vagy ERP rendszerhez kialakítható. A gyakorlatban a hazai KKV szektorban nem elterjedt, kivéve bizonyos iparágakban ahol nagy vállalatok beszállítóiként működnek a helyi vállalkozások és a nagyvállalatok elvárják az elektronikus adatszolgáltatást.

Ezzel szemben az e-számla pusztán a számlák elektronikus továbbítására és fogadására alkalmas. Fontos, hogyha egy elkészített papíros alapú számlát szkennelés után e-mailen küldünk el, az attól még nem elektronikus számla és továbbra is a papíros 1-es példány jelenti magát a számlát. Az elektronikus számlát hitelesítéssel kell ellátni (elektronikus aláírással), ettől lesz a számla e-számla. Az elektronikus számla a vevőhöz .PDF valamint .XML formában jut el. Az e-számla kiállításának módját több jogszabály is szabályozza (áfa, számviteli).